Establecido en 1810, es de los más antiguos jardines culturales, científicos y educativos que ha funcionado como tal ininterrumpidamente desde su fundación. Originalmente funcionaba como un jardín de la flora nativa y sección de la Escuela Central y este fue planificado por Franc Hladnik, que fue su primer director.

Los jardines contienen más de 4.500 diferentes especies y subespecies. un tercio de ellas son endémicas de Eslovenia, mientras que el resto proceden de otras partes de Europa y otros continentes. en colaboración con más de 270 jardines botánicos de todo el mundo, están involucrados en la investigación científica y las actividades educativas. Juegan un papel importante en el cultivo y la protección de especies endémicas de Eslovenia, en peligro de extinción, vulnerables y raras especies.

Desde 1991, el jardín existente disfruta de la protección como monumento de la jardinería ornamental.