Una gigantesca laguna central ovalada, de unos 12 por 7 km, está rodeada por altos acantilados de unos 300 metros de altura. Las aguas en el centro de la laguna tienen una profundidad de unos 400 metros, haciendo así posible la navegación de todo tipo de buques. El volcán proyectó a gran altura toba y ceniza. La toba cubrió la isla de un manto que preserva los restos materiales de la ciudad de Akrotiri como si de un molde se tratara. Según algunas teorías, pudo haber causado indirectamente el colapso de la civilización Minoica de la isla de Creta, situada 110 km al sur, causando un gigantesco maremoto.

Es el centro volcánico más activo del sur del Egeo, si bien lo que hoy en día queda es realmente una caldera inundada.

El volcán sigue activo y ha presenciado erupciones no explosivas, desde la gran erupción prehistórica.