Fundada en 1947 como sede del Museo de Arte Moderno, la galería funciona en un edificio de 1930, de uno de los arquitectos mas renombrados del siglo XX de Eslovenia, Edvard Ravnikar. En este edificio original se pueden apreciar las influencias de su maestro, Jože Plečnik, y de Le Corbusier, con quien Ravnikar había trabajado un período de tiempo en el 1939.
En 2007 el Edificio fue sometido a un cuidadoso proceso de renovación, para dar respuesta a los requerimientos de los museos actuales respetando los valores arquitectónicos del edificio.El proyecto, de Perovic, fue seleccionado mediante un concurso público.
Luego de la remodelación este museo alberga la colección y exhibiciones de arte moderno, mientras que los contenidos de arte contemporáneo se trasladaron al Museo de Arte Contemporáneo Metelkova (MSUM).
Ambos edificios se encuentran en una zona denominada Museum Quarter.